본 연구는 경영진-종업원 보상격차가 R&D(research and development) 효율성에 미치는 영향을 분석한다. 2013년부터 2022년까지 한국거래소에 상장된 기업을 대상으로 분석한 결과, 경영진-종업원 보상격차는 R&D 효율성에 부정적 영향을 미치는 것으로 나타났다. 특히, 경제적으로 설명되는 보상격차는 R&D 효율성에 긍정적 영향을, 반면 경제적으로 설명되지 않은 보상격차는 R&D 효율성에 부정적 영향을 각각 미치는 것으로 관찰되었다. 이러한 결과는 경제적으로 설명되지 않는 보상격차의 부정적 영향이 경제적으로 설명되는 보상격차의 긍정적 영향을 상쇄하기 때문으로 해석된다. 나아가, 경제적으로 설명되지 않는 보상격차의 부정적 영향은 경영진이 과대 보상됨과 동시에 종업원이 과소 보상되는 보상 구조에서 특히 두드러졌다. 본 연구의 결과는 보상격차가 항상 부정적인 것이 아니라, 그 형성 및 정당성 여부(즉, 보상격차가 pay inequality인지 pay inequity인지)에 따라 R&D 효율성에 미치는 효과가 달라질 수 있음을 보여준다. 이는 경영진의 과대 보상에만 초점을 맞춘 기존 논의를 보완하고 보상격차의 효과에 대한 이중적인 접근의 필요성을 제시한다.